Легенда или обоснование: Пустынь была основана в царствование Алексея Михайловича и названа в честь великомученицы Екатерины Александрийской, по преданию, она явилась правителю во время охоты и возвестила рождение дочери. Земля была царской, монастырь , липа, имеет прямое отношение к царской семье. 1918 году монастырь был отдан для размещения сестер эвакуированного из Польши Красностокского женского монастыря, но вскоре был закрыт. С 1931 года на его территории располагалась детская воспитательная колония, а в 1938—1953 годах действовала Сухановская особорежимная тюрьма (Спец объект "110 Берии). В 1991 году строения монастыря вновь были переданы Русской православной церкви, монастырь был восстановлен. Из- за большой секретности спец объекта, многие годы (до 1990 годов) были засекречены.
Пустынь была основана в царствование Алексея Михайловича и названа в честь великомученицы Екатерины Александрийской. По преданию, она явилась правителю во время охоты и возвестила рождение дочери в этом месте.
В 1918 году монастырь был отдан для размещения сестер эвакуированного из Польши Красностокского женского монастыря, но вскоре был закрыт. С 1931 года на его территории располагалась детская воспитательная колония, а в 1938—1953 годах действовала Сухановская особорежимная, самая ужасная тюрьма Берии (спец объект № 110). В 1991 году строения монастыря вновь были переданы Русской православной церкви, монастырь был восстановлен. 
Монастырь был заложен во второй половине XVII века по приказу царя Алексея Михайловича. По преданию, 24 ноября 24 ноября (4 декабря) 1658 года царю, отдыхавшему после охоты в Ермолинских Рощах, явилась великомученица Екатерина и возвестила: «Не ужасайся, царь, но благодари Господа. В эту ночь по Его воле разрешилась от бремени супруга твоя и принесла тебе дщерь на утешение». Вернувшись домой и узнав о пополнении в семье, Алексей Михайлович назвал новорожденную в честь святой, а на месте явления велел основать обитель.
Первые монастырские постройки были деревянными, в 1664 году здесь началось каменное строительство. Три года строительством руководил «каменных дел подмастерье» Иван Кузнечик, стрелец полка Артамона Матвеева. Летом 1667 года начались работы по внутреннему благоустройству зданий. Строительство и содержание пустыни финансировалось за счет личных средств государя. С 1674 года церковь с кладбищем, деревянными и двумя каменными строениями стала называться пустынью «Екатерининския Рощи». Освящение каменной церкви состоялось 11 октября 1679 года в присутствии государя и его приближенных. 
Период царствования Екатерины II стал временем активного строительства и расцвета монастыря. Немаловажную роль в восстановлении Екатерининской пустыни сыграли митрополит Московский Платон (Левшин) и настоятель обители иеромонах Мелхиседек, которого впоследствии стали называть обновителем монастыря.
В 1899 году были пущены поезда по Рязанско-Уральской дороге, которая проходила недалеко от монастыря. Вследствие этих изменений расстояние от ближайшей железнодорожной станции до монастыря сократилось до двух километров, а число паломников возросло. Паломничества в Екатерининскую пустынь совершались целыми приходами.